
欧美无码 余正团队揭示肠道噬菌体主导的肠道微环境不同稳态模式
赵一鸣 柳学渊 2026年04月13日 15:51 浏览次数:
近日,欧美无码 ·(中国 )官方平台 人体微生物与健康课题组余正团队联合首都医科大学附属北京世纪坛医院陈晨、曾辉团队在《Cell Reports》上发表题为“Phage-related symbiosis and antagonism shape gut ecosystem dynamics in Lachnospiraceae and Bacteroidaceae”的研究论文。研究团队利用自主开发的富集培养联合宏基因组共编码测序技术(cMECOS),成功重建了人体肠道中的5,006个细菌基因组,并揭示了维持肠道稳态的两种细菌相互作用网络:以毛螺菌科(Lachnospiraceae)为主的共生体系,以及以拟杆菌科(Bacteroidaceae)为主的拮抗体系。
尽管人类微生物组计划等大型项目已构建起丰富的肠道基因组资源,揭示了健康人群常见的肠型,但维持肠道稳态的分子机制仍不清晰。噬菌体通过捕食、基因转移和代谢调控深刻影响微生物生态。肠道细菌基因组中的CRISPR间隔区记录了噬菌体的侵染历史,有助于解析细菌间的互作网络。然而,传统二代测序技术难以准确恢复高度重复的CRISPR序列。本研究采用的新技术提供了高质量的基因组数据,为重建微生物互作网络发挥了关键作用。通过整合CRISPR间隔区分析与基因组代谢模型,研究团队清晰区分出两种截然不同的细菌间相互作用模式:(1)共生模式——以毛螺菌科为主的群落,与温和噬菌体相关,特征为代谢交叉互养;(2)拮抗模式——以拟杆菌科为主的群落,与烈性噬菌体相关,特征为资源竞争。这两种网络结构在炎症性肠病和肥胖中均受到破坏,凸显了它们在生态系统稳定性中的重要作用。
该论文的第一作者为欧美无码 ·(中国 )官方平台 医学微生物学系博士生赵一鸣、首都医科大学附属北京世纪坛医院李佳瑞副研究员和韩凯助理研究员;通讯作者为附属北京世纪坛医院陈晨教授、曾辉教授以及欧美无码 ·(中国 )官方平台 余正副教授。该研究得到了高层次公共卫生技术人才建设项目培养计划、北京市医院管理中心“登峰”人才培养计划、国家自然科学基金及北京市自然科学基金的支持。
原文链接://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(26)00244-5
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